Durante a realização do exame, podem ser colhidas pequenas amostras de tecido para análise microscópica detalhada. O mesmo exame permite, também, colocação de balão intragástrico para tratamento de obesidade, colocação de sondas em pacientes com dificuldade de deglutição; retirada de lesões elevadas, pólipos; tratamento de lesões; remoção de objetos estranhos, como moedas engolidas por crianças, entre outros.